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浙江迅速推出达摩院AI算法：疑似病例基因检测仅需30分钟
发布时间：2020年02月01日 14:43:28 阿里巴巴 人已围观
简介浙江省疾控中心于2月1日上线了自动化全基因组检测分析平台，依靠阿里达摩院研发的AI算法，使得疑似病例的基因分析时间从原来的数小时缩短至半小时。这一技术进步将大大提高疫情...
原本需要数小时的疑似病例基因分析，现在缩短至仅需半小时！
2月1日消息，今天，浙江省疾病预防控制中心推出了基于阿里达摩院开发的AI算法的自动化全基因组检测分析平台来提升病例基因分析效率，这意味着在抗击疫情方面，疑似病例的基因分析时间将大大减少，使得应对疫情的时间变得更加充足！
目前，全国范围内新冠疫情依然复杂严峻，及时与准确的诊断对疫情防控至关重要。公开数据显示，该病毒是已知基因组序列最长的病原体之一，基因组序列全长达到29847bp，临床诊断时需要将患者样本与该病毒的基因序列进行比对，以得到诊断结果。
新型冠状病毒的结构示意图
目前许多医院采用的核酸检测方法只能识别病毒基因的一部分。由于病毒可能发生变异，这种检测方式对整个基因组的概念好比盲人摸象，一旦病毒变异，就可能出现漏检现象。
浙江省的全基因组检测分析平台是由浙江省疾病预防控制中心、阿里达摩院医疗AI团队和杰毅生物技术公司联合研发的。该平台运用全基因组检测技术而非传统的核酸检测，能够对疑似病例的病毒样本进行全面的基因序列分析和比对，有效避免由于病毒变异引起的漏检，并将原本需要几小时的全基因分析程序缩短到半小时，显著提升了疑似病例的确诊效率和准确性。
达摩院算法专家顾斐博士在基因检测分析现场
自疫情开始以来，达摩院的算法专家顾斐博士迅速抵达浙江省疾控中心，针对新型冠状病毒的基因特征开展分析，并提出了多个算法模型。在序列比对阶段，达摩院增加了分布式设计以提升比对速度；在病毒序列的拼接过程中，运用了以分布式设计为基础的de Bruijn图算法，确保能够准确检测变异病毒。
浙江省疾控中心基因测序项目负责人孙逸博士指出：“该平台依托阿里云的强大计算能力与达摩院的新算法，为病毒分析提供了重要支持，基于这一平台，未来有望在短期内扩大检测范围覆盖所有确诊病例，同时为未来疫苗与药物的研发奠定坚实基础。”
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